預制菜潔凈廠房無菌實驗室的規劃與建設將決定預制菜質量和安全的關鍵要素。確保實驗室內的無菌狀態，減少微生物污染的風險。提高實驗室工作效率和實驗準確性。保證實驗人員的人身安全。
生鮮食品類預制菜的凈化等級可能定為30萬級，半熟成品類預制菜選擇10萬級。實驗室內部裝修應使用易于清潔、抗菌的材料，如無縫環氧樹脂或自流平地面、瓷磚等。
實驗室應由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。預制菜無菌凈化車間分為內外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。準備室用于配制培養基和樣品處理等，室內應設有試劑柜、存放器具或材料的專柜。
實驗室布局遵循環保、節能、高效的原則，滿足通風、采光、溫度、濕度的要求。
空氣凈化系統應采用初效、中效、高效三級過濾系統，確保空氣質量達到“相對無塵”的標準，實驗室內部應維持正壓狀態，防止外界污染物侵入。
設置更衣室、風淋室，以及獨立的人行通道和物料傳輸通道，控制溫度在18°C至26°C，濕度在45%至65%，以減少有害微生物的繁殖。
確保車間有充足的自然采光或人工照明，配置自動控制系統，保持潔凈操作間的靜壓梯度，定期對空氣質量、溫濕度等環境參數進行監測。
通過科學合理的設計和規劃，可以創建一個滿足預制菜研究、檢測和開發需求的無菌實驗室環境。
