DNA實驗室分為四個相對獨立的區(qū)域： DNA 提取區(qū)、 PCR 擴增區(qū)、 檢測區(qū)和檢材保存實驗數(shù)據(jù)分析處理區(qū)。
原始試劑混配室：應(yīng)為正壓間，在微環(huán)境百級超凈臺內(nèi)操作，以防止其他程序功能間對本操作間的污染。
DNA提取室：應(yīng)為微負壓間，設(shè)置排風系統(tǒng)，以防止核酸提取時可能產(chǎn)生的氣溶膠對人員的侵害和對其他程序功能間的擴散污染。
PCR擴增室：同樣應(yīng)為微負壓間，設(shè)置排風系統(tǒng)，以防止大量擴增產(chǎn)物對其他程序功能間的擴散污染。
檢測室：為微負壓間，設(shè)置排風系統(tǒng)，以防止擴增產(chǎn)物在電泳測序過程中的擴散污染。
緩沖間：如設(shè)置緩沖間，功能間內(nèi)可均為正壓，而在緩沖間內(nèi)設(shè)置負壓，氣流從其雙道門的門縫處分別向緩沖間內(nèi)流動，以合理的氣流組織方式避免各功能間的交叉污染。
實驗室應(yīng)設(shè)置實驗區(qū)和辦公區(qū)。實驗區(qū)應(yīng)包括試劑儲存、準備及配制區(qū)，檢材保管區(qū)、檢材前處理區(qū)、DNA提取區(qū)、擴增準備區(qū)、擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物檢測區(qū)、數(shù)據(jù)分析區(qū)等，建有數(shù)據(jù)庫的實驗室應(yīng)設(shè)置DNA數(shù)據(jù)庫工作區(qū)，相鄰區(qū)域進行有效隔離。對于DNA提取區(qū)，法醫(yī)生物檢材和比對樣本的DNA提取應(yīng)在不同區(qū)域進行分離；涉及微量、腐敗物證檢材檢驗的實驗室，應(yīng)另設(shè)專門區(qū)域進行DNA提取。對于開展二代測序檢驗的實驗室，應(yīng)另設(shè)置文庫構(gòu)建區(qū)、核酸定量區(qū)。對于開展RNA、蛋白質(zhì)等檢驗項目的實驗室，應(yīng)另設(shè)置專門的工作區(qū)。
實驗室內(nèi)溫度、濕度和潔凈度控制應(yīng)能滿足儀器正常運行和不同實驗程序的需要。實驗室應(yīng)滿足生物樣品保存的要求，配備必要的溫度、濕度控制設(shè)備以及安全設(shè)施。為防止氣溶膠的污染，實驗室應(yīng)定期通風和消毒。各區(qū)域應(yīng)有明確的區(qū)域標記，避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。檢驗鑒定流程應(yīng)單向流動，必要時實現(xiàn)人員的單向流動。實驗室應(yīng)設(shè)有限制進入的標識和相應(yīng)措施，防止未授權(quán)者訪問。實驗室應(yīng)制定廢棄樣品和有害廢棄物處置的程序。
有潔凈度、 壓力梯度、恒溫恒濕等特殊要求的實驗室凈高為 2.5 米-2.7 米，實驗室走廊凈寬為 2.5 米-3.0 米.
功能間均為正壓，DNA提取室、PCR擴增室為微負壓，緩沖間設(shè)置負壓，氣流從其雙道門的門縫處分別向緩沖間內(nèi)流動，特殊實驗區(qū)采用非單向流、三級過濾、各自獨立送/回風、集中（或獨立）新/排風的凈化系統(tǒng)。
實驗室應(yīng)根據(jù)所處理的生物樣本的危害程度，采取相應(yīng)的生物安全防護措施，如配備生物安全柜、高壓滅菌器等。工作人員應(yīng)接受生物安全培訓(xùn)，掌握正確的操作方法和防護技能。
DNA 實驗室在 10 萬級到萬級左右。 地板用 PVC 比較好， 相對耐用,花色也有選擇技巧,即使老化更換也簡便。 有些單位也采用環(huán)氧樹脂自流坪地面， 不過不推薦, 地板不耐磨， 且不容易維護和更新。
單人單面的工作空間中，走道間距應(yīng)不小于1200mm，置物高度約1500mm，操作間隙約750mm。
雙人雙面的工作空間中，走道間距應(yīng)不小于1500mm，置物高度和操作間隙同上。
安全設(shè)備間的走道間距應(yīng)大于6英尺（約1800mm）。
主實驗室的潔凈度達到CLASS7，輔助間的潔凈度達到CLASS8.3。實驗區(qū)域內(nèi)地面應(yīng)選用優(yōu)質(zhì)復(fù)合型/通體型PVC地面，多層工藝處理，PVC無縫焊接，防滲漏、防腐蝕、易清潔。
DNA實驗室設(shè)計規(guī)范涉及多個方面，需要綜合考慮實驗室的布局、氣路、安全、潔凈度、溫濕度、照明、電氣以及裝修材料等多個因素。以確保實驗環(huán)境的舒適性、安全性和實驗結(jié)果的準確性。
