潔凈實驗室供暖、通風和空調系統是潔凈實驗室設計的核心部分，選擇單向流（層流）或亂流（非單向流）設計。單向流可使潔凈空氣在實驗室內平行流動，有效去除微粒和微生物，適用于對潔凈度要求較高的區域；亂流則通過多次循環換氣來保證空氣潔凈度，適用于一般潔凈實驗室。

明確劃分潔凈區、緩沖區、污染區等，確保各區之間互不干擾。例如，可將實驗操作區設置為潔凈區，人員和物料的進出通道設置為緩沖區，實驗廢棄物處理區設置為污染區。在不同區域之間設置物理隔離，如采用氣密門、傳遞窗等，防止空氣和污染物的交叉流動。

設計合理的人員和物料流動路線，避免人流和物流的交叉。可以設置專門的人員通道和物料通道，人員進入潔凈區前需經過更衣室、風淋室等凈化設施，物料則需通過傳遞窗或物料凈化間進行清潔和消毒后再進入潔凈區。

潔凈室不同級別之間壓差≥5pa，與室外壓差≥10pa，保證氣流從“清潔”區域流向“污染”區域。

根據實驗室的潔凈度等級要求選擇合適的過濾效率，選用低噪音、高效的通風設備，如風機濾網單元（FFU）、空調機組等，確保室內空氣的新鮮和流通。定期對通風設備進行清洗和保養，檢查風機的運行狀況、皮帶的松緊度、過濾器的堵塞情況等，及時發現和解決問題。

安裝恒溫恒濕空調系統或其他溫度控制設備，根據實驗室的需求設定合適的溫度范圍。溫度控制系統需要能夠迅速響應環境變化，確保實驗室內的溫度穩定，避免溫度波動對實驗結果的影響。潔凈室內的濕度通常應控制在40%-60%之間，以防止靜電或霉菌問題。可通過安裝除濕機或加濕器等設備來調節濕度，同時要注意設備的維護和清潔，防止滋生細菌和霉菌。

引入先進的樓宇自動化系統（BAS），實現對溫度、濕度、潔凈度、壓差等環境參數的精準自動控制和實時監測。通過傳感器網絡收集數據，并利用智能算法自動調節空調系統、通風設備和凈化裝置的運行狀態，以維持穩定的實驗環境，減少人為干預帶來的誤差和不穩定因素。